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Orario di ricevimento Lunedì 15-16:30 - Dipartimento di Scienze Biochimiche
   
Programmi dei corsi Biologia animale e vegetale (10 CFU)
Laurea Specialistica in Farmacia
  Biologia animale e vegetale (5 CFU)
Laurea Specialistica in Chimica e Tecnologia Farmaceutiche
  Biologia animale (3 CFU)
Laurea Triennale in Tossicologia dell'Ambiente
  Biologia animale e vegetale (6 CFU)
Laurea Triennale in Informazione Scientifica sul Farmaco
  Biologia cellulare (2 CFU)
Laurea Triennale in Tecniche Erboristiche)
  Biologia generale (3 CFU)
Laurea Triennale in Controllo di Qualità...
  Ingegneria degli Anticorpi (3 CFU)
Laurea Triennale in Biotecnologie - Indirizzo Farmaceutico
  Biochimica Cellulare (9 CFU)
Laurea Specialistica in Biotecnologie Farmaceutiche
  Biochimica delle Fermentazioni (dott. M. Ramazzotti)(5 CFU)
Laurea Specialistica in Biotecnologie Farmaceutiche
  Bioinformatica delle proteine (prof. G.Manao, dott. M. Ramazzotti) (3 CFU)
Laurea Specialistica in Farmacia
   
Calendario Esami
Biologia: per Farmacia, CTF, ISF, CQ, TA 07/03/07, 21/03/07 e 17/04/07 ore 11:00 Dipartimento di Scienze Biochimiche


Programma del corso di Biologia animale e vegetale
Laurea specialistica in Farmacia
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Basi chimiche della biologia. Macromolecole: lipidi, trigliceridi, carboidrati, proteine , acidi nucleici (struttura, ruolo, mutazioni e sistemi di riparo). Autotrofi ed eterotrofi. Organizzazione della cellula. Cellule dei procarioti. La divisione cellulare dei procarioti . Cellule degli eucarioti. Organuli cellulari: struttura e funzione. Membrane interne. Citoscheletro. Membrane cellulari: struttura e proprietà. Endocitosi ed esocitosi. Trasporto attivo e passivo. Nucleo e cromosomi. Ciclo cellulare. Mitosi. La riproduzione asessuale e sessuale. La meiosi. Enzimi e catalisi specifica. Regolazione dell'attività enzimatica. La molecola dell'ATP. Le vie metaboliche che liberano energia. Glicolisi, fermentazione, respirazione. Genetica molecolare dei virus e dei procarioti. Controllo delle trascrizione nei procarioti. Espressione genica negli eucarioti. Struttura dei geni eucariotici e regolazione. Meccanismi di traduzione del segnale. Genetica mendeliana e postmendeliana. Sistema immunitario. Sistemi di difesa non specifici nell'uomo. Generalità del sistema immunitario. Ruolo del sistema immunitario. Gli anticorpi e loro ruolo. Regno vegetale: generalità. Cellula vegetale e sue caratteristiche. La parete. Plastidi. Cloroplasti. Leucoplasti ed amido. Fotosintesi. Ciclo di Calvin. Gimnosperme. Angiosperme. Monocotiledoni. Dicotiledoni. Anatomia delle piante: radice, fusto, foglie, seme, fiore. Livelli di organizzazione nella struttura delle piante. Tessuti e sistemi di tessuti. Meristemi. Crescita secondaria. Riproduzione e sviluppo. Sistema di sostegno, trasporto e protezione nelle piante. Anatomia della foglia. Funzionamento degli stomi. Piante CAM. Immagazzinamento delle sostanze nutrizionali. Riproduzione sessuale e asessuale. Nutrizione delle piante. Regolazione dello sviluppo nelle piante. Ormoni vegetali e regolatori chimici. Adattamenti nutrizionali e all'ambiente.
Testi consigliati:
"Biologia" Solomon et al. (Versione Integrale) Ed. EdiSES 2005
"Biologia" Campbell Ed. Zanichelli
"Biologia" Purves et al. Ed. Zanichelli
"Biologia" Arms & Champ Ed. Piccin

Programma del corso di Biologia Animale e Vegetale
Laurea specialistica in CTF
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Basi chimiche della biologia. Macromolecole: lipidi, trigliceridi, carboidrati, proteine , acidi nucleici (struttura e ruolo, mutazioni, sistemi di riparazione). Organizzazione della cellula. Cellule dei procarioti. La divisione cellulare dei procarioti. Cellule degli eucarioti. Organuli cellulari: struttura e funzione. Membrane interne. Citoscheletro. Membrane cellulari: struttura e proprietà. Endocitosi ed esocitosi. Trasporto attivo e passivo. Nucleo e cromosomi. Ciclo cellulare e sua regolazione. Mitosi. La riproduzione asessuale e sessuale. La meiosi. Enzimi e catalisi specifica. Regolazione dell'attività enzimatica. La molecola dell'ATP. Le vie metaboliche che liberano energia. Regno vegetale: generalità. Cellula vegetale e sue caratteristiche. La parete. Plastidi. Cloroplasti. Leucoplasti ed amido. Fotosintesi . Gimnosperme. Angiosperme. Monocotiledoni. Dicotiledoni. Anatomia delle piante: radice, fusto, foglie, seme, fiore.
Testi consigliati:
"Biologia" Solomon et al. (Versione Integrale) Ed. EdiSES 2005
"Biologia" Campbell Ed. Zanichelli
"Biologia" Purves et al. Ed. Zanichelli
"Biologia" Arms & Champ Ed. Piccin

Programma del corso di Biologia animale
Laurea triennale in Tossicologia dell'Ambiente
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Basi chimiche della biologia. Ciclo del carbonio, azoto, fosfato, zolfo,ossigeno, acqua. Autotrofi ed eterotrofi. Macromolecole: lipidi, carboidrati, proteine, acidi nucleici (ruolo, mutazioni, sistemi di riparo). Cellule dei procarioti. La divisione cellulare dei procarioti. Cellule degli eucarioti. Organuli cellulari: struttura e funzione. Membrane interne. Citoscheletro. Membrane cellulari: struttura e proprietà. Endocitosi ed esocitosi. Trasporto attivo e passivo. Nucleo e cromosomi. Ciclo cellulare. Mitosi. Meiosi. Enzimi. Regolazione dell'attività enzimatica. La molecola dell'ATP. Le vie metaboliche che liberano energia. Ecosistema: definizione ed esempi. Organismi coinvolti nei cicli biogeochimici. Il ciclo dei materiali negli ecosistemi. Intervento dell'uomo sugli ecosistemi.
Testi consigliati:
"Fondamenti di Biologia" Solomon et al. (Versione Ridotta) Ed. EdiSES 2005
"Scienze Ambientali" Miller ed. EdiSES

Programma del corso di Biologia Animale e Vegetale
Laurea triennale in Informazione Scientifica sul Farmaco
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Basi chimiche della biologia. Macromolecole: lipidi, trigliceridi, carboidrati, proteine, acidi nucleici (struttura e ruolo, mutazioni, sistemi di riparazione). Organizzazione della cellula. Cellule dei procarioti. La divisione cellulare dei procarioti. Cellule degli eucarioti. Organuli cellulari: struttura e funzione. Membrane interne. Citoscheletro. Membrane cellulari: struttura e proprietà. Endocitosi ed esocitosi. Trasporto attivo e passivo. Nucleo e cromosomi. Ciclo cellulare e sua regolazione. Mitosi. La meiosi. Mutazioni genetiche esempi di malattie genetiche. Enzimi. La molecola dell'ATP. Le vie metaboliche che liberano energia. Generalità del sistema immunitario. Anticorpi e loro ruolo. Regno vegetale: generalità. Cellula vegetale e sue caratteristiche. Cellulosa. La parete. Plastidi. Cloroplasti. Leucoplasti ed amido. Fotosintesi. Muschi, Felci, Gimnosperme. Angiosperme. Monocotiledoni. Dicotiledoni. Anatomia delle piante: seme, radice, fusto, foglie, fiore, frutti.
Testi consigliati:
"Biologia" Solomon et al. (Versione Integrale) Ed. EdiSES 2005
"Biologia" Campbell Ed. Zanichelli
"Biologia" Purves et al. Ed. Zanichelli
"Biologia" Arms & Champ Ed. Piccin

Programma del corso di Biologia Cellulare
Laurea triennale in Tecniche Erborstiche
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Macromolecole: lipidi, trigliceridi, carboidrati, proteine, acidi nucleici (struttura, ruolo, mutazioni e sistemi di riparo). Autotrofi ed eterotrofi. Organizzazione della cellula. Cellule degli eucarioti. Membrane cellulari: struttura e proprietà. Endocitosi ed esocitosi. Trasporto attivo e passivo. Citoscheletro. Organuli cellulari: struttura e funzione. Nucleo e cromosomi. Ciclo cellulare. Mitosi e meiosi. Mutazioni genetiche: esempi di malattie genetiche.
Testi consigliati:
"Fondamenti di Biologia" Solomon et al. (Versione Ridotta) Ed. EdiSES 2005

Programma del corso di Biologia Generale
Laurea triennale in Controllo di Qualità...
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Basi chimiche della biologia. Macromolecole: lipidi, trigliceridi, carboidrati, proteine, acidi nucleici (struttura, ruolo, mutazioni e sistemi di riparo). Autotrofi ed eterotrofi. Organizzazione della cellula. Cellule dei procarioti. La divisione cellulare dei procarioti. Cellule degli eucarioti. Organuli cellulari: struttura e funzione. Membrane interne. Citoscheletro. Membrane cellulari: struttura e proprietà. Endocitosi ed esocitosi. Trasporto attivo e passivo. Nucleo e cromosomi. Ciclo cellulare. Mitosi. La riproduzione asessuale e sessuale. La meiosi. Enzimi e catalisi specifica. Regolazione dell'attività enzimatica. La molecola dell'ATP. Le vie metaboliche che liberano energia. Glicolisi, fermentazione, respirazione
Testi consigliati:
"Fondamenti di Biologia" Solomon et al. (Versione Ridotta) Ed. EdiSES 2005

Programma del corso di Ingegneria degli Anticorpi
Laurea triennale in Biotecnologie - Indirizzo farmaceutico
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Struttura delle immunoglobuline. Variazioni nelle sequenze degli anticorpi. Generazione del repertorio di diversità. Ricombinazione genica delle immunoglobuline. Il legame antigene anticorpo. Produzione di anticorpi monoclonali e selezione. Anticorpi catalitici. Uso degli anticorpi come sonde molecolari. "Umanizzazione" degli anticorpi. Anticorpi chimerici: tecniche di produzione. Library fagiche di scFv (single chain Fragment variable). Selezione e produzione di anticorpi umani scFv. Biopanning. Produzione di scFv solubili. Applicazioni degli anticorpi. Sviluppo di agenti terapeutici basati su anticorpi. Esempi di anticorpi come farmaci già in commercio.
Testi consigliati:
"Immunologia cellulare e molecolare" Abbas et al. ed. Piccin
"Immunologia" Roitt et al. ed. Zanichelli
"Biotecnologie Farmaceutiche" Crommelin e Sindelar ed. Zanichelli

Programma del corso di Biochimica delle Fermentazioni
Corso di Laurea Specialistica in Biotecnologie Farmaceutiche
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Il processo fermentativo: cenni storici. Biomolecole di interesse nei processi fermentativi. Enzimi e cofattori. Applicazioni industriali degli enzimi. Tecniche di immobilizzazione. Utilizzo degli enzimi immobilizzati. Biosensori. Metabolismo degli zuccheri nei procarioti. Glicolisi. Via di Entner Doudoroff. Via della fosfochetolasi. Via dei pentoso fosfati. Ciclo di Krebs. Respirazioni aerobiche e non. Fermentazione alcolica, omolattica, eterolattica, degli acidi misti, butirrica, aceton-butilica, propionica. Reazione di Stickland. Catabolismo e anabolismo degli aminoacidi. Biosintesi di vitamine (cenni). Biosintesi di antibiotici (cenni). Introduzione allo studio dei flussi metabolici. Metodi di accrescimento dei microrganismi. Cinetiche di accrescimento. Cinetica della crescita bilanciata. Generalità sui fermentatori.Reattori discontinui. Cinetica di formazione dei prodotti. Condizioni fisiche e chimiche che influenzano l'accrescimento. Strumentazione e controlli di processo. Produzioni fermentative.
Testi consigliati:
“Chimica delle fermentazioni” Quaglierini et. al ed. Zanichelli
“Chimica delle fermentazioni e Microbiologia industriale” Marzona ed. Piccin
“I principi di Biochimica di Lehninger” Nelson e Cox ed. Zanichelli



Programma del corso di Biochimica Cellulare
Corso di Laurea Specialistica in Biotecnologie Farmaceutiche
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Lipidi. Vie metaboliche di lipidi speciali. Sfinfolipidi e sfingolipidosi umane. Sfingolielina. Cerebrosidi. Gangliosidi. Galattorerebrosidi. Derivati lipidici, acidi grassi e colesterolo.
Sistema nervoso. Caratteristiche del neurone. Lipidi caratteristici del sistema nervoso. Biosintesi di fosfolipidi specifici : fosfatidilcolina, fosfatidiletanolammina, fosfatidelserina, fosfatidilinositolo. Reazioni catalizzate dalla fosfolipasi A1 eA2. Lisofosfolipidi. Proteine presenti nel tessuto nervoso. Mielina, Calmodulina. Neurotubuli, neurofilamenti, micrfilamenti. Potenziale d'azione. Proteine canale.
Metabolismo sistema nervoso. Carboidrati. Anossia e glicolisi. Esochinasi. Lipidi, corpi chetonici. Amino acidi e loro metabolismo. Acido glutammico. Glutammato e aspartato : neurotrasmettitori aminoacidici eccitatori. Recettori per l'acido glutammico. GABA e glicina: neurotrasmetitori e loro recettori. Proteina cinasi C . Barriera ematoencefalica. Neurotrasmettitori catecolamminergici: sintesi e disturbi metabolici. Neurotrasmettitori peptidici.
Muscolo (Devlin-Garrett). Caratteristiche strutturali del muscolo: scheletrico, cardiaco, liscio, mioepiteliale. Miosina struttura e attività ATPasica. Assemblaggio di molecole di miosina. Meccanismo contrazione e proteine coinvolte. Ruolo del calcio.Muscolo striato e muscolo liscio. Muscolo cardiaco. Mioglobina. Creatina. Creatina cinasi ed isoenzimi. Metabolismo del glucosio, glicogeno e ruolo adrenalina.
Sangue: aspetti clinici e metodologici. Metabolismo dell'eritrocita. Emoglobina. Tipi di emoglobina. Gruppo eme: sintesi. Ferro: distribuzione e cinetica. Trasferrina, ferritina. Ferro-proteine. ( Devlin Garrett)
Vitamine. (Devlin e Garrett)
Vitamine idrosolubili implicate nel metabolismo enenrgetico. Vitamine gruppo B. Acido folico.Vitamina C. Vitamina E. Vitamina K. Vitamina A e meccanismo della visione (Garrett). Vitamina D e suoi derivati e omeostasi del calcio.
Sintesi e degradazione dei nucletidi (Garrett cap 27).
Biosintesi purine. La biosintesi di IMP. Regolazione della biosintesi delle purine. Le vie di recupero delle purine.Degradazione delle purine . Produzione di acido urico. Xantina ossidasi. Malattia di Lesch-Nyhan, sindrone di immunodeficienza combinata. Biosintesi delle pirimidine. Sintesi di UTP e CTP. Degradazione pirimidine. Deossiribonucleotidi. La ribonucleotide reduttusi. Sintesi dei nucleotidi della timida e ciclo del tetraidrofolato.
*Digestione ed assorbimento. Controllo ormonale del tratto gastrointestinale. Secrezione esocrina di enzimi e controllo dei processi secretori. Gastrina, colecistochinina, secretina. Trasporto attraverso le cellule epiteliali.assorbimento NaCl e NaHCO3. Secrezione di HCl- . Digestione ed assorbimento delle proteine. Aspartato proteasi e meccanismo di azione. Serinaproteasi e meccanismo di azione. Assorbimento di aminoacidi. Digestione d assorbimento dei carboidrati. Assorbimento monosaccaridi. Digestione ed assorbimento dei lipidi (non fatto)
*Sintesi proteica e antibiotici. Processamento della catena polipeptidica. Sequenze segnale per il direzionamento proteico. Traffico nucleare e poro nucleare. Importina e RanGAP. Glicosilazione nel direzionamento proteico. O ed N glicosilazione. Direzionamanto proteico e degradazione. Uiquitina e proteasoma. Endocitosi. Clatrina.
*Regolazione ciclo cellulare. Proteine chinasi e livelli di ciclina. Regolazione della sintesi CDKs e ciclica. Oncogèni . Apoptosi (cenni)
*Ormoni e regolazione. Regolazione trascrizione ormoni steroidei. Regolazione ormonale del metabolismo energetico. Insulina, glucagone e diabete. Obesità e regolazione della massa corporea. Leptina e sua segnalazione. Neuropeptide Y. Adiponectina. Grelina.
*Glicobiologia. Glicosamminoglcani e matrice extracellulare. Acido ialuronico ed eparina. Glicoconiugati. Proteoglicani e glicoproteine. Attacco degli oligosaccaridi alle proteine. Strutture e ruolo dei glicoconiugati. Lectine e processi biologici. Interazione lectine e carboidrati. Ruolo degli oligosaccaridi nel riconoscimenti ed adesione cellulare.
*Proteine legate ai lipidi. Miristilazione. Prenilazione con legame tioestere. GPIlazione con legame ammidico. Raft lipidici. Caveole.
Testi consigliati:
“Biochimica con aspetti clinici” Devlin ed. Idelson Gnocchi
“Biochimica” Garrett e Grisham ed. Zanichelli


Programma del corso di Bioinformatica delle Proteine
Corso di Laurea Specialistica in Farmacia, prof. G. Manao, dott. M. Ramazzotti
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Banche dati proteiche. Interrogazione delle banche dati. Allineamento di sequenze proteiche. Matrici di sostituzione. Allineamento con gap. Allineamento globale e locale. BLAST e FASTA. Allineamento multiplo. Visualizzazione degli allineamenti. Profili di multiallinemento. Ricerca di pattern e motivi funzionali nelle proteine. Banche dati dei profili proteici. Filogenesi molecolare. L'orologio molecolare. Analisi della struttura primaria delle proteine. Struttura secondaria delle proteine. Strumenti per la predizione della struttura secondaria. Visualizzazione tridimensionale delle proteine. RasMol. Predizione della struttura tridimensionale. Homology modelling. Swiss PDB Viewer. Introduzione al docking molecolare.
Testi consigliati:
G.Valle et al. - "Introduzione alla bioinformatica" - Zanichelli
A.M. Lesk - "Introduzione alla bioinformatica" - McGraw Hill
A.Tramontano - "Bioinformatica" - Zanichelli

Lezioni "Bioinformatica delle proteine" (prof. G.Manao, dott. M. Ramazzotti)
1: Banche dati (1)
2: Banche dati (2)
3: Allineamenti pairwise
4: BLAST e FASTA
5: Allineamenti multipli
6: Filogenesi molecolare
7: Analisi di struttura primaria
8: Predizione di struttura secondaria - RasMol
9: Predizione di struttura 3D - Swiss PDB Viewer
10: Homology modelling
11: Docking e Drug Discovery

ESERCITAZIONE: Testo